La ausencia de sustentabilidad en los territorios se manifiesta a través de una serie de síntomas, o procesos indicadores de una evolución indeseable del ecosistema en el tiempo. Un conjunto de síntomas constituye un síndrome; de allí que a menudo se hable de síndromes de in-sustentabilidad que afectan a los territorios. Aquellos que representan desafíos mayores para los territorios rurales del país son los siguientes:

• La agriculturización y la expansión de la frontera agrícola
• Intensificación de la producción animal a través del confinamiento
• La contaminación ambiental asociada a los modelos productivos
• La desertificación y la degradación de tierras
• La ‘viviendización’ o crecimiento urbano no organizado
• El aumento en la variabilidad del clima y el cambio climático

Estos procesos impactan negativamente sobre la competitividad, el desarrollo, el ambiente y la equidad social en los territorios, sobre la calidad de los hábitats y las dinámicas espacio-temporales de los diferentes componentes de la biodiversidad, y sobre los servicios ecosistémicos asociados.